Archives par mot-clef : bioinformatique

Concevoir des protéine nouvelles — une approche « ingénieur » depuis de nouvelles structures jusqu’à des fonctions programmable

En bref L’intelligence artificielle (IA) entraînée sur de vastes ensembles de données de séquences et de structures de protéines permet désormais de composer – sans partir de protéines trouvées dans la nature (=de novo ) des protéines avec de nouvelles … Continuer la lecture

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IA et éducation : menace ou opportunités… quelques réflexions

L’Intelligence Artificielle et l’éducation… une menace sur les activités et l’évaluation ? La façon dont la science se fait et se publie est déjà en transformation… Dans la revue Science, Sibel Erduran (2023) ici , titre « L’IA transforme la façon … Continuer la lecture

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La biologie digitale ou la biologie de terrain ? faut-il les opposer ? -> des scénarios testés en classe

Humanités digitales et biologie numérique … C’est une exigence fédérale (CIIP, 2018), les implications éducatives et sociétales de ces changements doivent être intégrées. A Genève on parle d’humanités digitales  (DIP, 2018, DIP, 2020). La question de la place du numérique … Continuer la lecture

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l’IA pour prédire quelles variantes d’un gène produisent des protéines pathogènes

Prédire quelles mutations missense produisent des protéines pathogènes Un algorithme d’apprentissage automatique utilise la prédiction de structure pour repérer les mutations pathogènes Dans un commentaire sur l’article original, Marsh & Teichmann(2023) ici écrivent « La plupart des mutations génétiques à l’origine … Continuer la lecture

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Un nouveau Lifescope !

L’uni vous offre désormais aussi un LifeScope à SciencesII, 30 quai Ansermet 1205 Genève – complémentaire et collaborant avec le Bioscope et BiOutils. Le Bioscope aborde le rapport à soi et à son propre corps, ainsi que le lien aux … Continuer la lecture

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Découverte de la 100e espèce de mammifères sauvages de Suisse – tout est dans les méthodes !

Comment on définit une espèce et les méthodes qui permettent de distinguer 2 espèces de muscardin très semblables. Autrefois c’était par des critères morphologiques qu’on distinguait les espèces. Faute d’accès aux séquences d’ADN, on était un peu obligé de supposer … Continuer la lecture

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la ployploïdie aide à survivre au stress de blessures ou de catastrophes environnementales ?

La polyploïdie apparaît dans de nombreuses situations de stress, et même dans le développement normal Dans une news de Science Elizabeth Pennisi (2023). ici présente plusieurs recherches remettant en cause – ou en tous cas nuançant passablement – ce qui … Continuer la lecture

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Transfert horizontal : nous sommes 8% OGM ? LightOfEvolution.org offre l’opportunité d’explorer avec les élèves

Notre génome est-il « pur »  ? Ce que le génome humain a d’unique, qui définit (en partie) notre nature humaine, est éclairé de manière nouvelle par des recherches récentes comparant et analysant les nombreux génomes disponibles. Le projet LightOfEvolution.org offre l’opportunité … Continuer la lecture

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Brûler un codon stop permet la vie de certains organismes et pourrait guérir certaines mucoviscidoses

Quand une transgression du code permet la vie et guérit peut-être de la mucoviscidose Dans nos ouvrages de référence le code génétique est présenté comme universel, et les 3 codons UAA, UAG,UGA comme « Stop », signifiant la fin de la traduction. … Continuer la lecture

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« Stories » et BD-sur les protéines, illustrations schématiques SwissBioPics

Protein Spotlight (ISSN 1424-4721) est une revue mensuelle rédigée par l’équipe Swiss-Prot du SIB Swiss Institute of Bioinformatics.Les articles Spotlight  décrivent une protéine spécifique ou une famille de protéines sur un ton informel. Elles sont passionnantes et peuvent donner de … Continuer la lecture

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