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Archives par mot-clé : bioinformatique
Nobel : « Sa grande qualité était l’aptitude à goûter l’étrangeté qui marque l’esprit des véritables chercheurs. »
Nobel physiologie et médecine : au départ une découverte qu’on n’attendait pas … Dans la revue Science Catherine Offord (2024) ici parle d’une découverte inattendue » ‘Out of the blue’ discovery of RNAs that regulate genes wins Nobel » le prix … Continuer la lecture
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La biologie numérique : une transformation inévitable de la biologie, de nouvelles opportunités pour enseigner, pour l’esprit critique … et une exigence institutionnelle
La biologie est profondément transformée par le numérique, et l’accès – désormais aisé en classe – à des données scientifiques authentiques offre de nombreuses opportunités de vérifier, d’éprouver et de manipuler pour les élèves et les enseignants. La culture numérique … Continuer la lecture
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l’ADN : 2 merguez attachées par le milieu , un plat de spaghetti, ou une structure organisée pour réguler l’expression ?
Voir l’ADN se déplier et se replier pour activer / désactiver les gènes est désormais possible On sait depuis plusieurs années que l’ADN n’est dans le noyau en général ni des X « 2 merguez attachées par le milieu » ni … Continuer la lecture
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Comment on analyse l’ADN pour établir une généalogie ou un degré de filiation – pour l’anthropologie, pour retrouver ses ancêtres, pour identifier un criminel
Comprendre les méthodes si on veut comprendre la portée d’une recherche …. Les banques de données généalogiques basées sur l’ADN ont connu un développement impressionnant. JTS aborde d’abord les méthodes – pour comprendre la portée des affirmations trouvées dans la … Continuer la lecture
Concevoir des protéine nouvelles — une approche "ingénieur" depuis de nouvelles structures jusqu'à des fonctions programmable
En bref L’intelligence artificielle (IA) entraînée sur de vastes ensembles de données de séquences et de structures de protéines permet désormais de composer – sans partir de protéines trouvées dans la nature (=de novo ) des protéines avec de nouvelles … Continuer la lecture
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IA et éducation : menace ou opportunités… quelques réflexions
L’Intelligence Artificielle et l’éducation… une menace sur les activités et l’évaluation ? La façon dont la science se fait et se publie est déjà en transformation… Dans la revue Science, Sibel Erduran (2023) ici , titre « L’IA transforme la façon … Continuer la lecture
La biologie digitale ou la biologie de terrain ? faut-il les opposer ? -> des scénarios testés en classe
Humanités digitales et biologie numérique … C’est une exigence fédérale (CIIP, 2018), les implications éducatives et sociétales de ces changements doivent être intégrées. A Genève on parle d’humanités digitales (DIP, 2018, DIP, 2020). La question de la place du numérique … Continuer la lecture
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l'IA pour prédire quelles variantes d'un gène produisent des protéines pathogènes
Prédire quelles mutations missense produisent des protéines pathogènes Un algorithme d’apprentissage automatique utilise la prédiction de structure pour repérer les mutations pathogènes Dans un commentaire sur l’article original, Marsh & Teichmann(2023) ici écrivent « La plupart des mutations génétiques à l’origine … Continuer la lecture
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Un nouveau Lifescope !
L’uni vous offre désormais aussi un LifeScope à SciencesII, 30 quai Ansermet 1205 Genève – complémentaire et collaborant avec le Bioscope et BiOutils. Le Bioscope aborde le rapport à soi et à son propre corps, ainsi que le lien aux … Continuer la lecture
Découverte de la 100e espèce de mammifères sauvages de Suisse – tout est dans les méthodes !
Comment on définit une espèce et les méthodes qui permettent de distinguer 2 espèces de muscardin très semblables. Autrefois c’était par des critères morphologiques qu’on distinguait les espèces. Faute d’accès aux séquences d’ADN, on était un peu obligé de supposer … Continuer la lecture