Archives de catégorie : AuthenTIC Data : des données authentiques pour la classe

Pour chaque thème Expériment@l offre des ressources authentiques :- soit l’accès à des expériences à faire à l’uni ou en classe,
– soit des données brutes ou partiellement traitées en vue de leur utilisation en classe.

Les données authentiques proposées par Expériment@l

Publié le 9 mai 2012 par Francois.Lombard@unige.ch

Les données authentiques de séquence d’ADN  obtenues à la plateforme Génomique de l’UniGe  avec l’AGP de l’UniGe  (Réservé aux membres) S’inscrire à Expériment@l ? Les séquences mélangées à d’autres , soit au total une 60aine de séquences sont disponibles ici.txt … Continuer la lecture →

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L'alignement se prépare…

Publié le 15 avril 2011 par Francois.Lombard@unige.ch

L’alignement n’est pas une affaire simple Si on veut travailler sérieusement avec ces séquences, il faut ajuster les alignements à la main : Estella Poloni de l’AGP, a bien voulu partager avec Expériment@l ce travail d’alignement. Le séquençage Sanger (complément … Continuer la lecture →

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La glissade du séquençage qui rend flou

Publié le 14 avril 2011 par Francois.Lombard@unige.ch

Une glissade qui brouille le séquençage Complément de la page Comment exploiter ces séquences d’ADN en classe ? Estella Poloni l’AGP,  note que  « pour 3 séquences  ça a visiblement glissé vers 16180. » Cela signifie qu’une séquence avec une longue suite … Continuer la lecture →

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Techniques : Comment on a séquencé.

Publié le 30 mars 2011 par Francois.Lombard@unige.ch

Protocole de séquençage de la région HVS‐1 de l’ADN mitochondrial humain En bref : Prélèvement par cyto-brosse, purification de l’ADN total, amplification du fragment d’intérêt (entre 16060 et 16360) par PCR puis séquençage Sanger. Opération réalisée gracieusement par Patrick Descombes, … Continuer la lecture →

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Séquençage d'élèves AuthenTIC !

Publié le 10 mars 2011 par Francois.Lombard@unige.ch

De l’authentique ADN d’élève !
Des élèves ont donné un frottis buccal pour séquencer une petite portion de leur ADN, et vont le comparer à d’autres dans le respect de l’anonymat. Les techniques, les enjeux éthiques et un peu de recul donneront du sens aux données (Données réservées aux membres Expériment@l) Continuer la lecture →

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